Organi zavoda so:
- svet zavoda,
- direktor zavoda,
- strokovni direktor zavoda,
- strokovni svet zavoda.
Predsednik sveta zavoda se izvoli izmed predstavnikov ustanovitelja.
Enega člana sveta zavoda, ki predstavlja delavce zavoda volijo delavci na splošnih volitvah.
Člani sveta zavoda se izvolijo oziroma imenujejo za mandatno dobo štirih let in so lahko po preteku mandatne dobe ponovno izvoljeni oziroma imenovani.